Fernando Gaibor era una de las mayores promesas del fútbol ecuatoriano. El volante central conformó la selección sub 20 que hizo bulla en el Mundial de 2011, cuando Ecuador quedó fuera en octavos de final ante Francia. Gaibor fue elegido el Joven Revelación Serie A en 2011 con Emelec, cuando su equipo quedó subcampeón.
Luego, fue elegido cuatro veces en el once ideal del campeonato ecuatoriano (2013, 2014, 2015, 2017). Los seleccionadores de turno se frotaban las manos porque parecía que se encontraba un mediocampista con buen despliegue físico y una nítida entrega de esférico. En 2014 fue pretendido por Borussia Dortmund y Fiorentina, aunque finalmente no se concretó un traspaso.
Pero todo quedó en eso, una promesa y un jugador que nunca sobrellevó el peso de vestir de amarillo. Gaibor fue convocado por Reinaldo Rueda a la selección mayor, pero una lesión le impidió jugar el Mundial 2014. En abril de 2014, estando en Emelec, fue convocado por primera vez a la Selección de fútbol de Ecuador, dirigida por el técnico Reinaldo Rueda, para un microciclo.
En 2016 fue convocado por Gustavo Quinteros en reemplazo de Pedro Larrea que sufrió una lesión, para los partidos de eliminatorias frente a las selecciones de Paraguay y Colombia; debutando por eliminatorias en el minuto 82 en la derrota frente a Colombia 3-1. En 2017 lograría una continuidad con la selección, anotando sus primeros goles en los amistosos contra El Salvador y Trinidad y Tobago.
Y desapareció del radar. El 25 de enero de 2018 se confirmó su traspaso al Club Atlético Independiente, que le ofreció un contrato por cinco temporadas y compró el 70% de su pase en 4.200.000 dólares. De esta manera, se convirtió en el segundo futbolista ecuatoriano en ponerse la camiseta del Rey de Copas.
La última vez que Gaibor defendió los colores de la Tri se remonta al 2019, cuando estuvo presente en los amistosos de septiembre contra Perú y Bolivia en septiembre, luego de eso no hubo compromisos para la Tri debido a la polémica de buscar el nuevo DT.
Nunca logró adaptarse en Argentina. Al año siguiente fue cedido a préstamo a Al-Wasl, de los Emiratos Árabes Unidos, del que debió regresar en julio, porque el club argentino reclamaba que se cumpla un contrato que se extiende hasta 2022. Todo fue de mal en peor. Gaibor quiso fichar por Guayaquil City en 2020, pero el cuadro de Avellaneda quiso demandar al jugador.
Finalmente, Gaibor logró fichar por el cuadro porteño. Entre 2020 y 2021, el mediocampista disputó 21 cotejos, destacando por su gran efectividad de pases y opciones creadas de peligro. Tanto así, que Independiente del Valle decidió fichar al fluminense. Con los ‘Rayados’ lleva cinco compromisos y ya se ganó el puesto de titular.
El llamado del jugador se da por la baja por lesión de Sebastián Méndez, así como por la posibilidad de que Moisés Caicedo no sea prestado para la jornada por negativa de la Premier League.
